磷酸二氢钠的禁忌症主要包括高磷血症、肾结石指感染所致的含磷酸铵镁盐结石、严重的肾功能损害以及内生肌酐清除率小于正常的30%。

此外，还有一些需要注意的情况：

禁止与钙盐、氢氧化铝或氧化镁等同时使用，因为能减少磷的吸收。

禁止与肾上腺皮质激素尤其是盐皮质激素、促肾上腺皮质激素、雄激素等合用，因为合用可增加水钠潴留。

禁止与维生素D同时使用，因为维生素D能增加口服磷的吸收，合用时易发生高磷血症。